导读 加州大学圣地亚哥分校的研究人员发布了新的指导方针，可以帮助科学家在量化 DNA 和蛋白质之间的相互作用时显著改善他们的研究结果。了解...
加州大学圣地亚哥分校的研究人员发布了新的指导方针，可以帮助科学家在量化 DNA 和蛋白质之间的相互作用时显著改善他们的研究结果。了解这些相互作用对于我们了解整个人类生物学至关重要，还可以帮助科学家开发针对多种疾病(包括许多癌症)的新疗法。
研究人员重点研究了 Spike-in 标准化，这是一种广泛使用的分子生物学技术，有助于确保结果准确可靠。Spike-in 标准化涉及在研究样本之前向样本中添加已知量的染色质(DNA 和相关蛋白质)，这有助于研究人员解释多个样本之间的差异。Spike-in 标准化对于比较两种情况特别有用，例如评估药物的影响(比较治疗组与未治疗组)或关键基因的突变或缺失(比较正常组与突变组)。
通过探索利用spike-in标准化的公开数据集，研究人员能够识别出spike-in标准化容易被误用的常见场景，以及在该技术中建立额外的质量控制措施和其他“护栏”可以改善结果或避免误解。
通过重新分析这些数据并进行额外的实验，该团队为使用spike-in归一化的研究人员制定了九项关键建议，这些建议可以大大提高其结果的准确性。这些措施包括确保采取一致的质量控制步骤、遵循计算分析的最佳实践以及使用其他分析技术验证结果。
“许多研究都利用了峰值归一化，而我们的研究结果对从这种方法得出的生物学结论提出了质疑，”资深作者 Alon Goren 博士说。“我们的建议可以帮助解释峰值归一化的一些缺陷，因此我们仍然可以从这种宝贵的技术中获益。”
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